往來港澳通行證每證60元，往來港澳一次有效簽注每件15元，二次有效簽注每件30元，短期（不超過一年）多次有效簽注每件80元，一年以上（不含一年）兩年以下（含兩年）多次有效簽注每件120元，兩年以上（不含兩年）三年以下（不含三年）多次有效簽注每件160元，長期（三年以上，含三年）多次有效簽注每件240元 。
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補充：內地居民可以單獨申請往來港澳通行證但不申請簽注嗎？
內地居民可按需單獨申領往來港澳通行證，無須同時申請簽注 。但實際前往港澳地區時 ， 須辦妥有效往來港澳通行證及赴港澳簽注 。
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