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1、及時檢查：培育菌種的過程中，在各級菌種擴繁三到七天內，要每天檢查一次 ， 觀察接種菌塊和四周是否正常 。
2、溫度適宜：要為其創造適宜菌絲生長的溫度環境，瓶內的菌溫一般會比室溫高二到三度，每隔五天要降溫一度，并在冬季做好升溫、降溫處理 。
3、防潮措施：菌種對空氣濕度的要求較高，要在培育室裝有風扇、排氣扇、暖氣管等設備，并且保持室內的空氣相對濕度為百分之五十到七十 。
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菌種保藏的原理菌種保藏的原理是運用一些方式降低生物體內的代謝，達到延長生命、減少變異的目的，其保藏的方式多樣，有斜面培養、穿刺培養、皰肉培養基培養等，其中斜面培養是將菌種接種在適合的固體斜面培養基上，等到菌充分生長后，放入冰箱中保藏 。
菌種保藏的目的微生物在使用和傳代的過程中，易發生污染、變異、死亡的情況，菌種保藏的意義在于盡可能保持其原有性狀和活力的穩定，保證菌種不會死亡、變異和污染，達到使用、研究等目的 。
菌種保藏的注意事項【菌種培育技術 木耳菌種培育技術】菌種保藏時，要挑選典型菌種的優良純種來進行保藏，一般保藏其休眠體，例如分生孢子、芽孢等，此外，需認為的創造環境條件，使微生物長時間處于代謝不活潑、生長受到抑制的狀態 。
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